Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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