Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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