Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP140Q13342 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms