Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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