Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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