Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN3Q13064 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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