Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms