Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHRNEQ04844 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHRNEQ04844 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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