Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms