Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms