Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms