Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms