Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN2Q02246 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms