Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1BQ00975 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms