Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms