Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms