Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms