Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S2P56377 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms