Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC13P55735 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms