Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP214P35658 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP214P35658 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP214P35658 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP214P35658 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP214P35658 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP214P35658 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP214P35658 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP214P35658 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUP214P35658 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP214P35658 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP214P35658 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP214P35658 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NUP214P35658 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP214P35658 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUP214P35658 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NUP214P35658 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP214P35658 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP214P35658 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP214P35658 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP214P35658 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP214P35658 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP214P35658 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP214P35658 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP214P35658 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP214P35658 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NUP214P35658 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms