Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms