Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms