Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCP25054 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCP25054 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCP25054 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
APCP25054 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCP25054 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCP25054 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCP25054 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCP25054 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCP25054 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCP25054 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCP25054 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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