Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ME2P23368 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ME2P23368 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ME2P23368 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ME2P23368 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ME2P23368 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ME2P23368 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms