Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALB2P22676 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALB2P22676 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALB2P22676 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALB2P22676 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALB2P22676 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALB2P22676 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALB2P22676 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CALB2P22676 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALB2P22676 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALB2P22676 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALB2P22676 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALB2P22676 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALB2P22676 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALB2P22676 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CALB2P22676 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALB2P22676 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALB2P22676 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms