Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRHP20396 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRHP20396 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRHP20396 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRHP20396 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRHP20396 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRHP20396 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRHP20396 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRHP20396 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRHP20396 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRHP20396 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRHP20396 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRHP20396 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRHP20396 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRHP20396 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRHP20396 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRHP20396 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms