Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms