Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH1P12830 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH1P12830 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms