Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms