Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMP1P11279 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMP1P11279 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMP1P11279 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMP1P11279 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms