Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHGAP10645 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHGAP10645 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHGAP10645 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHGAP10645 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHGAP10645 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHGAP10645 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHGAP10645 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHGAP10645 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHGAP10645 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHGAP10645 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHGAP10645 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHGAP10645 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHGAP10645 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHGAP10645 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHGAP10645 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHGAP10645 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHGAP10645 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHGAP10645 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHGAP10645 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHGAP10645 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHGAP10645 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms