Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLA1P09884 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLA1P09884 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLA1P09884 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLA1P09884 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLA1P09884 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLA1P09884 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLA1P09884 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLA1P09884 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLA1P09884 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
POLA1P09884 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLA1P09884 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLA1P09884 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLA1P09884 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLA1P09884 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLA1P09884 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLA1P09884 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLA1P09884 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLA1P09884 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLA1P09884 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLA1P09884 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLA1P09884 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLA1P09884 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLA1P09884 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLA1P09884 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms