Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms