Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPLNO95428 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms