Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CCNDBP1O95273 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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CCNDBP1O95273 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CCNDBP1O95273 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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