Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 PFN2-204ENST00000460404 942 ntTSL 1 (best)14□□□□□ -0.172e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PROC-206ENST00000429925 581 ntTSL 313.77□□□□□ -0.212e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.222e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 SLC26A6-218ENST00000482282 1029 ntTSL 513.61□□□□□ -0.232e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.292e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.342e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PROC-207ENST00000431364 566 ntTSL 412.33□□□□□ -0.442e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PROC-205ENST00000427769 598 ntTSL 411.93□□□□□ -0.52e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-216ENST00000498169 662 ntTSL 211.46□□□□□ -0.572e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-207ENST00000468323 894 ntTSL 211.13□□□□□ -0.632e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 SLC26A6-210ENST00000431213 556 ntTSL 410.86□□□□□ -0.672e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PROC-210ENST00000474030 501 ntTSL 410.47□□□□□ -0.732e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-208ENST00000475518 637 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.742e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TNFRSF10D-201ENST00000312584 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.842e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.212e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.382e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.432e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 NINL-207ENST00000496509 735 ntTSL 513.64□□□□□ -0.238e-8■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.942e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.172e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IGF2BP3-210ENST00000476938 500 ntTSL 215.06■□□□□ 02e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IGF2BP3-206ENST00000468005 2948 ntTSL 514.92□□□□□ -0.022e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.693e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 KMT2A-209ENST00000531904 4320 ntTSL 219.11■□□□□ 0.653e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 KMT2A-210ENST00000532204 499 ntTSL 218.74■□□□□ 0.593e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.453e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-224ENST00000534748 580 ntTSL 317.7■□□□□ 0.423e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.423e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.343e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 KMT2A-206ENST00000527869 481 ntTSL 317.09■□□□□ 0.333e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 KMT2A-211ENST00000533790 804 ntTSL 217.09■□□□□ 0.333e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.213e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 HAGLR-201ENST00000413969 545 ntTSL 316.07■□□□□ 0.163e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 BAG6-246ENST00000438149 714 ntTSL 315.61■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.033e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 HAGLR-203ENST00000417086 984 ntTSL 214.52□□□□□ -0.093e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 KMT2A-208ENST00000529852 3323 ntTSL 213.08□□□□□ -0.313e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 UCKL1-204ENST00000430743 888 ntTSL 313□□□□□ -0.333e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 BAG6-252ENST00000453833 554 ntTSL 512.16□□□□□ -0.463e-6■□□□□ 8.3
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PRPF4O43172 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.493e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 MIR1914-201ENST00000607800 80 ntBASIC11.91□□□□□ -0.53e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 HS1BP3-IT1-201ENST00000449391 600 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.553e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-219ENST00000480929 2421 ntTSL 210.93□□□□□ -0.663e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-202ENST00000392102 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.683e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 BAG6-261ENST00000469182 653 ntTSL 310.2□□□□□ -0.783e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.93e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-213ENST00000461181 590 ntTSL 48.61□□□□□ -1.033e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-217ENST00000475950 587 ntTSL 38.34□□□□□ -1.073e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.13e-6■□□□□ 8.3
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PRPF4O43172 TTLL4-221ENST00000494428 829 ntTSL 37.68□□□□□ -1.183e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-204ENST00000417196 811 ntTSL 57.45□□□□□ -1.223e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-207ENST00000434241 476 ntTSL 57.26□□□□□ -1.253e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-218ENST00000480472 765 ntTSL 47.11□□□□□ -1.273e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.313e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-215ENST00000467841 973 ntTSL 46.78□□□□□ -1.323e-6■□□□□ 8.3
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PRPF4O43172 JMJD8-214ENST00000569441 1428 ntTSL 528.96■■■□□ 2.239e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.889e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-208ENST00000566199 719 ntTSL 325.02■■□□□ 1.69e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.579e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 AK4-206ENST00000497030 834 ntTSL 1 (best)24.82■■□□□ 1.569e-6■□□□□ 8.2
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PRPF4O43172 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.397e-9■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 SAMD4B-212ENST00000602243 672 ntTSL 323.5■■□□□ 1.357e-9■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-207ENST00000565302 1975 ntTSL 323.39■■□□□ 1.339e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 POLR2F-206ENST00000443002 1890 ntTSL 223.28■■□□□ 1.329e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-213ENST00000569396 729 ntTSL 523.02■■□□□ 1.289e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 PACSIN3-204ENST00000528201 864 ntTSL 322.69■■□□□ 1.229e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.229e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 AK4-203ENST00000470888 1043 ntTSL 222.55■■□□□ 1.29e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.119e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 PACSIN3-205ENST00000528462 1560 ntTSL 221.45■■□□□ 1.029e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.019e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.999e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 PACSIN3-207ENST00000530513 912 ntTSL 321.22■□□□□ 0.999e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.919e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.919e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-210ENST00000567901 785 ntTSL 320.39■□□□□ 0.859e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 POLR2F-212ENST00000492213 550 ntTSL 420.14■□□□□ 0.819e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 PACSIN3-203ENST00000525725 683 ntTSL 220.11■□□□□ 0.819e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.789e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 RSAD1-208ENST00000515221 1029 ntTSL 219.83■□□□□ 0.779e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 DECR2-216ENST00000633348 762 ntTSL 319.77■□□□□ 0.769e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.689e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 CTSA-206ENST00000480961 513 ntTSL 219.27■□□□□ 0.689e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 ARFGAP1-209ENST00000518794 2727 ntTSL 1 (best)19.02■□□□□ 0.649e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 ZNF326-204ENST00000394583 1956 ntTSL 1 (best)18.79■□□□□ 0.69e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 DECR2-217ENST00000633923 509 ntTSL 318.48■□□□□ 0.559e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.549e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 DECR2-204ENST00000437024 1738 ntTSL 218.39■□□□□ 0.539e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 DECR2-206ENST00000445291 1078 ntTSL 518.18■□□□□ 0.59e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 ARFGAP1-205ENST00000468975 2640 ntTSL 218.13■□□□□ 0.499e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 PACSIN3-208ENST00000531226 654 ntTSL 518.08■□□□□ 0.489e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 DECR2-205ENST00000439661 1618 ntTSL 217.83■□□□□ 0.449e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.399e-6■□□□□ 8.2
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