Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM233B4DJY2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms