Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DGG1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DGG1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms