Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF839A8K0R7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms