Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms