Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IGSF9BQ9UPX0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms