Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RDH8Q9NYR8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RDH8Q9NYR8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RDH8Q9NYR8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RDH8Q9NYR8 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RDH8Q9NYR8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RDH8Q9NYR8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RDH8Q9NYR8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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RDH8Q9NYR8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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