Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms