Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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