Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms