Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms