Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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