Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms