Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms