Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms